墨卓生物开放基于分类特征基因集去除单细胞微生物基因组物种组装结果中污染的专利 成功单细胞基因组组装结果中污染的高通量检测且智能化去除 (墨卓生物科技)

专利摘要显示，本发明提供了一种基于分类特征基因集去除单细胞微生物基因组物种组装结果中污染的方法、系统及设备。本发明基于特征基因集在物种基因组内的发生法则，逐渐搜寻失掉长度阈值与掩盖度阈值的最佳组合，用于对单细胞微生物基因组物种组装结果启动过滤，从而去除由背景read组装而成的污染contig。本发明提供的方法不只抑制了现有技术中无法智能判别长度阈值的缺点，且在判定contig掩盖度阈值时，也无需假定物种的contig的掩盖度呈正态散布或能否多峰，从而成功了单细胞基因组组装结果中多胞污染以及背景污染的高通量检测且智能化去除，尽或许失掉最优的污染去除结果。